合肥市疾控中心成立于2003年12月，是公益一類事業(yè)單位，核定編制133人，目前現(xiàn)有在職職工151人，其中高級(jí)職稱31人、中級(jí)職稱47人；專業(yè)技術(shù)人員占91.3%；擁有博士2人、碩士48人、本科71人，本科以上人員占比79.3%。中心內(nèi)設(shè)11個(gè)專業(yè)科室、7個(gè)職能科室及3個(gè)開(kāi)發(fā)區(qū)分站。主要承擔(dān)全市重大公共衛(wèi)生服務(wù)，突發(fā)公共衛(wèi)生事件處置，學(xué)校衛(wèi)生、環(huán)境衛(wèi)生、食品衛(wèi)生和生活飲用水監(jiān)測(cè)，慢性病防控和全民健康促進(jìn)等工作。
        中心堅(jiān)持以人的健康為中心、科研創(chuàng)新為動(dòng)力，力求補(bǔ)短板、建機(jī)制、促改革,全面提升疾病防控綜合服務(wù)能力。近年來(lái)政府支持力度不斷加大，市級(jí)財(cái)政投入實(shí)現(xiàn)數(shù)倍增長(zhǎng)。中心新址已啟動(dòng)建設(shè)，將于2021年投入使用，建筑面積達(dá)2.2萬(wàn)平方米，其中實(shí)驗(yàn)室1.2萬(wàn)平方米。中心全面推行“6S”精益管理，樹(shù)立疾控新形象。創(chuàng)新健康知識(shí)傳播模式，制作“小吉守健康”系列動(dòng)漫健康公益宣傳片，不斷向市民傳播健康知識(shí)。中心實(shí)驗(yàn)室具有CMA（中國(guó)計(jì)量認(rèn)證）和CNAS（中國(guó)合格評(píng)定國(guó)家認(rèn)可委員會(huì)）實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可資質(zhì)，可開(kāi)展7類163個(gè)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可和12類485個(gè)省級(jí)計(jì)量認(rèn)證檢測(cè)項(xiàng)目，發(fā)現(xiàn)的一株H9N2亞型流感毒株被WHO選為疫苗推薦株。同中國(guó)疾控中心、安醫(yī)大、安徽大學(xué)建立科研合作關(guān)系，實(shí)現(xiàn)科研能力新突破。“衛(wèi)生應(yīng)急學(xué)科”為省級(jí)重點(diǎn)學(xué)科，環(huán)境衛(wèi)生、慢性病管理、學(xué)校衛(wèi)生、免疫規(guī)劃、艾滋病防控等學(xué)科建設(shè)處于全省領(lǐng)先地位。不斷加強(qiáng)人才隊(duì)伍建設(shè)，建立內(nèi)部激勵(lì)機(jī)制，首次開(kāi)展“十大突出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)”、“十大杰出青年”評(píng)選等。
        中心承接國(guó)家空氣污染對(duì)人群健康影響監(jiān)測(cè)、公共場(chǎng)所危害因素監(jiān)測(cè)、COPD監(jiān)測(cè)、心血管高危人群綜合干預(yù)、城市癌癥早診早治、世行高血壓防治綜合管理等項(xiàng)目。成功申報(bào)國(guó)家環(huán)境健康風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估試點(diǎn)單位和全國(guó)首批疾病預(yù)防控制信息化試點(diǎn)單位。腫瘤監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)從2013年起連續(xù)六年被《中國(guó)腫瘤登記年報(bào)》收錄，2010～2012年腫瘤登記數(shù)據(jù)被世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究署《五大洲癌癥發(fā)病率》收錄。先后榮獲全國(guó)先進(jìn)集體、安徽省“五一勞動(dòng)獎(jiǎng)狀”、中共合肥市委先進(jìn)黨組織、合肥市政府先進(jìn)集體、合肥市“三八紅旗”先進(jìn)集體等稱號(hào)。